Z finansowania FKIS nie można skorzystać w przypadku, gdy:
a. przedsiębiorstwo jest w trudnej sytuacji finansowej, w której pozyskanie środków z FKIS przesądziłoby o jego przetrwaniu, b. przedsięwzięcie podlegające finansowaniu nie jest wyodrębnione przynajmniej organizacyjnie c. trwałość finansowa przedsięwzięcia zależy od pozyskania przyszłych dotacji/dofinansowań ze środków publicznych (pod uwagę należy wziąć skalę dywersyfikacji źródeł finansowania PS, historię i potencjał PS, powiązane ryzyka), d. przedmiot działania polega na działalności opiekuńczej niezgodnej z unijną polityką deinstytucjonalizacji, e. finansowaniu podlegać miałyby wyłącznie koszty bieżące, nie prowadzące do rozwoju przedsiębiorstwa, f. inwestycja mogłaby narazić dobre imię podmiotów zaangażowanych w funkcjonowanie FKIS, niezależnie od efektów biznesowo-społecznych.